Glavna manastirska crkva Svetog Nikole je iz XV vijeka, o čemu svjedoči povelja zetskog vladara Balše III. Na njenim ostacima u XIX vijeku je podignuta prostranija gradjevina, koja u sebi nosi ostatke freskopisa stare crkve. Druga manastirska crkva smještena je na brežuljku i posvećena je Svetoj Trojici i potiče iz XVII vijeka. Njena najveća umjetnička vrijednost je freskoslikarstvo, koje je radio zograf Radul i pozlaćeni ikonostas Dimitrija Daskala iz XVII vijeka.

U sklopu manastirskog kompleksa je i konak i nekadašnja škola u kojoj su svojevremeno monasi opismenjavali paštrovačku djecu. Crkve raspolažu izuzetnim znamenitostima: ikonama, te starim rukopisima i dokumentima. Tu se čuva i rukopisno Jevandjelje okovano srebrnim koricama koje je, prema predanju, Paštrovićima 1600. godine poklonio crnogorski vladika Danilo. Veoma atraktivan za posjetioce je i veliki kameni sto za kojim je decenijama zasijedao i paštrovački sud zvani "bankada".